Анализы на генетику: как выявляют наследственные риски

Анализ на генетику — это исследование ДНК, которое ищет в генах изменения (мутации), способные вызвать наследственную болезнь или повысить риск её развития, а также «спящие» мутации-носительство, которые можно передать детям. Материал — кровь или мазок с внутренней стороны щеки, а результат — не диагноз, а вероятность, которую дальше трактует вместе с вами врач-генетик.

Виды анализов

Анализы на генетику различаются по тому, сколько ДНК они «читают» за один раз — от одной точки в одном гене до всего генома. Чем шире охват, тем дольше расшифровка и выше цена. Выбор метода зависит от повода: известная мутация в семье требует таргетного теста на конкретный ген, неясная картина — широкой панели или экзома.

Кариотипирование — самый старый метод, он оценивает число и структуру хромосом целиком и находит крупные перестройки, например лишнюю копию хромосомы. Таргетное секвенирование ищет мутацию в одном известном гене — так проверяют BRCA1 при семейном раке груди или ген, уже найденный у родственника. NGS-панель за один запуск читает от десятков до нескольких сотен генов одной группы риска: онкологической, кардиологической, панели нарушений обмена. Полноэкзомное секвенирование охватывает все белок-кодирующие участки генома, где сосредоточено большинство известных патогенных мутаций, а полногеномное — всю молекулу ДНК целиком. Отдельно стоит неинвазивный пренатальный тест (НИПТ): по крови беременной оценивают риск хромосомных аномалий у плода без прокола плодного пузыря — подробнее о сроках и других анализах при беременности можно прочитать в статье о графике обследований.

Показания

Анализ на генетику назначают по конкретному поводу, а не всем подряд: подтверждённая мутация у кровного родственника, повторяющееся заболевание в нескольких поколениях семьи, планирование беременности при известном наследственном риске или необъяснимый диагноз у ребёнка. Скрининговые тесты — носительство и НИПТ — предлагают шире, независимо от семейной истории.

Врач обычно рекомендует тестирование при одном из следующих поводов:

• одно и то же заболевание встречается у нескольких близких родственников;
• болезнь у родственника проявилась в необычно молодом возрасте;
• планируется беременность при близкородственном браке или известном наследственном заболевании в семье;
• было две и более потери беременности подряд без установленной причины;
• у ребёнка есть врождённые пороки развития или задержка развития неясного происхождения;
• у кровного родственника уже найдена конкретная патогенная мутация.

Сравнение методов

Методы анализа на генетику отличаются охватом, скоростью расшифровки и ценой: чем больше генов проверяют за один раз, тем дольше готовится результат и выше стоимость исследования. Дороже всего обходится не сам забор биоматериала, а биоинформатическая расшифровка: чем больше генов и чем реже встречается методика, тем больше часов работы генетика уходит на интерпретацию находок. Таблица ниже — ориентир по типам методов без привязки к конкретной лаборатории.

Точный список генов, срок и цену уточняйте при заказе конкретной панели — они отличаются даже внутри одного метода.

Подготовка

Для анализа на генетику не нужна голодная диета — результат не зависит от того, когда вы ели, в отличие от биохимии крови. Материалом служит венозная кровь или мазок с внутренней стороны щеки, для пренатального теста — кровь из вены беременной. Специальная подготовка нужна только в двух случаях: недавнее переливание крови и трансплантация костного мозга.

Мазок берут утром: за 30–60 минут до процедуры не едят, не пьют, не курят и не чистят зубы — посторонние клетки во рту искажают результат. Время суток и физическая нагрузка на ДНК не влияют, поэтому анализ можно сдать в любой удобный день. Исключение — недавнее переливание крови: в образце ещё циркулирует чужая ДНК донора, и тест по крови может показать не ваш генетический профиль, а его. То же касается людей после трансплантации костного мозга — им для генетического теста обычно берут не кровь, а мазок или волосяную луковицу. Об этих особенностях стоит заранее предупредить лабораторию.

Результаты

Результат анализа на генетику — не диагноз, а классификация найденного варианта ДНК по вероятности, что он вызывает болезнь. Международная система делит варианты на пять категорий: патогенный, вероятно патогенный, неопределённого значения (VUS), вероятно доброкачественный и доброкачественный. Отдельно указывают носительство — одну копию рецессивной мутации, которая никак не проявляется у самого человека.

Патогенный и вероятно патогенный варианты — повод для конкретных действий: усиленного наблюдения, ранних скринингов или превентивных мер, которые обсуждают с врачом. Вариант неопределённого значения (VUS) встречается чаще всего и не означает ни болезнь, ни её отсутствие — науке пока не хватает данных, чтобы отнести его к одной из крайних категорий; со временем, по мере накопления данных, классификацию могут пересмотреть в любую сторону. Носительство рецессивной мутации — например, гена муковисцидоза — обычно не влияет на здоровье самого носителя и становится значимым только тогда, когда такую же мутацию несёт партнёр: тогда у ребёнка есть шанс получить обе копии и заболеть.

Наследственные болезни

Чаще всего панели наследственных рисков ищут мутации в генах четырёх групп заболеваний: онкологических (например, BRCA1/2 при раке груди и яичников, синдром Линча при колоректальном раке), кардиологических (наследственные кардиомиопатии, синдром удлинённого QT, семейная гиперхолестеринемия), моногенных нарушений обмена и наследственных болезней крови.

К моногенным нарушениям обмена относят муковисцидоз, спинальную мышечную атрофию и фенилкетонурию — их обычно проверяют ещё в тесте на носительство перед планированием беременности. Среди наследственных болезней крови — талассемия, при которой снижается синтез гемоглобина (контролируют по анализу гемоглобина), и гемохроматоз — мутация в гене HFE, из-за которой организм накапливает избыток железа; для контроля используют анализ ферритина. Отдельная группа — наследственные эндокринные синдромы, включая семейные формы рака щитовидной железы, при которых после подтверждения риска дальше наблюдают за функцией железы по анализу ТТГ.

Красные флаги

Обратиться к генетику стоит раньше планового чек-апа, если в семейной истории есть один из тревожных признаков: несколько случаев одного и того же онкологического заболевания у близких родственников, внезапная сердечная смерть в молодом возрасте или уже известная мутация у кровного родственника.

Поводом для внеочередной консультации служат:

• рак груди, яичников или поджелудочной железы у двух и более родственников, особенно до 50 лет;
• внезапная сердечная смерть у родственника моложе 50 лет без очевидной причины;
• подтверждённая патогенная мутация у родителя, брата, сестры или ребёнка;
• две и более потери беременности подряд;
• врождённые пороки развития или необъяснимая задержка развития у ребёнка;
• близкородственный брак при планировании беременности.

Консультация генетика

Консультация генетика нужна и до анализа, и после — это не формальность, а часть точного результата. До теста врач по семейной истории подбирает конкретную панель или ген вместо избыточного и дорогого полногеномного секвенирования и заранее объясняет, что делать с разными вариантами находки. После теста генетик трактует результат в контексте вашей семьи, а не в отрыве от неё.

Если находят патогенный вариант, врач обычно предлагает каскадное тестирование — проверить на ту же мутацию близких родственников, у которых пока нет симптомов, чтобы вовремя начать наблюдение. Отдельная часть консультации — разговор о том, как жить с результатом: носительство или повышенный риск не приговор, а повод скорректировать график обследований, а не источник постоянной тревоги. Перед подписанием согласия на тест стоит обсудить, что вы хотите узнать, а что нет: например, не все готовы услышать о неизлечимых поздних заболеваниях вроде хореи Гентингтона, даже если тест технически может это показать.

Практика

Срок анализа на генетику зависит от объёма исследования: тест на одну известную мутацию готовят 1–2 недели, NGS-панель — от 2 до 4 недель, полноэкзомное секвенирование — до 6–8 недель из-за объёма расшифровки. Стоимость растёт вместе с числом генов и сложностью биоинформатического анализа, а не с ценой самого забора крови.

По ОМС генетическое тестирование делают по направлению врача при чётких медицинских показаниях — например, подтверждённый семейный синдром или патология у ребёнка; без направления и показаний тест сдают платно. В бланке результата обычно указывают название гена, конкретный вариант, его классификацию (патогенный, VUS и так далее) и рекомендацию — как правило, обратиться к генетику для интерпретации. Где именно сдавать анализ, стоит выбирать по общим критериям выбора лаборатории: точность, аккредитация и то, включена ли консультация специалиста в стоимость, — подробнее об этом в статье о выборе лаборатории. После подтверждения риска дальнейшее наблюдение обычно ведут обычными лабораторными тестами — например, биохимией крови при риске семейной гиперхолестеринемии.

Частые вопросы

Можно ли сдать анализ на генетику без направления врача?

Да, многие тесты в частных лабораториях доступны без направления. Но перед крупной панелью или полноэкзомным секвенированием лучше сначала проконсультироваться с генетиком — он поможет выбрать нужный объём теста и избежать лишних расходов на гены, не связанные с вашей семейной историей.

Анализ на генетику точно покажет, заболею ли я?

Нет, тест показывает риск, а не гарантию. Даже при патогенном варианте многое зависит от образа жизни и других генов — это называется неполной пенетрантностью. Отсутствие известных мутаций тоже не исключает риск полностью: часть наследственных факторов наука ещё не описала.

Нужно ли пересдавать анализ на генетику через несколько лет?

Обычно нет — ваша ДНК не меняется в течение жизни. Пересмотреть стоит не сам анализ, а его трактовку: классификация вариантов неопределённого значения со временем меняется по мере накопления новых данных, и старый результат иногда стоит показать генетику повторно.

С какого возраста можно сдать анализ на генетику ребёнку?

Тестирование на заболевания, которые проявляются в детстве, проводят в любом возрасте по назначению врача. А тесты на риски, которые реализуются только во взрослом возрасте, обычно откладывают до совершеннолетия — чтобы решение сдавать анализ человек принимал сам.

Чем анализ на генетику отличается от теста ДНК на происхождение?

Медицинский анализ ищет конкретные патогенные варианты в генах, связанных со здоровьем, и его трактует врач. Потребительские тесты «на происхождение» смотрят другие участки ДНК, дают вероятностную оценку этнического состава и не подходят для медицинских решений.

Источники

Материал подготовлен с опорой на официальные источники, которые публикуют клинические рекомендации и позицию по генетическому тестированию. Пользуйтесь ссылками ниже, чтобы проверить формулировки и терминологию из статьи в первоисточнике.

• Минздрав России — официальный портал ведомства, отвечающего за порядок оказания медико-генетической помощи в стране.
• Рубрикатор клинических рекомендаций Минздрава — база утверждённых клинических рекомендаций, включая протоколы по наследственным и орфанным заболеваниям.
• Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) — международные материалы по геномике и наследственным заболеваниям как направлению общественного здравоохранения.